《天使禁猎区》的故事发生在一个由天使、恶鬼、邪鬼和人类共同构成的世界中。神创造了所有生命，但也孕育了所有邪恶。故事从中空回廊封印的有机天使亚蕾克西儿的躯体被盗开始。邪鬼族王女九雷与其堂兄紫罗九音为了复活亚蕾克西儿，前往人界寻找其灵魂所托之人，遇上了这一世亚蕾克西儿的持魂者——无道刹那。当时，刹那正陷入与其胞妹无道纱罗的矛盾苦恋中，无暇顾他。与此同时，偷跑来人界的智天使肯达为解救被封印的前炽天使长兼天使军总司令狂天使罗洁爱儿，实施了“天使禁猎区”计划。随着各方势力的交织与冲突，人界、天界和魔界的新纪元即将揭开，一场前所未有的风暴即将席卷整个世界。