在人工智能與人類共存的未來城市，假面騎士巴爾坎與瓦爾基里面臨前所未有的危機。一場神秘的黑客攻擊導致大量AI失控，城市陷入混亂。巴爾坎的變身者飛電或人與瓦爾基里的變身者刃唯阿，不得不聯手對抗這場災難。然而，隨著調查深入，他們發現背後隱藏著更大的陰謀——一個試圖利用AI控制人類的邪惡組織正在暗中行動。
兩人在戰鬥中逐漸建立起深厚的信任，面對強大的敵人，他們必須超越自我，挖掘出各自隱藏的力量。與此同時，飛電或人內心的掙扎與刃唯阿對正義的執著交織成複雜的情感羈絆。在這場關乎人類未來的戰鬥中，他們不僅要保護城市，更要守護彼此的信念。
《假面騎士01外傳 假面騎士巴爾坎 瓦爾基里》以緊張的節奏、深刻的角色塑造與震撼的戰鬥場面，帶來了假面騎士系列的全新篇章。