《我们仍未知道那天所看见的花的名字 剧场版》讲述了六个从小一起长大的孩子，在升上高中后逐渐疏远的故事。宿海仁太是个宅男，安城鸣子变得有些叛逆，松雪集和鹤见知利子进入了重点高中，久川铁道则选择放弃学业去旅行。唯独本间芽衣子，那个在童年不幸去世的女孩，依然保持着纯真的模样，并且只有仁太能够看到她。有一天，芽衣子请求仁太帮她实现一个愿望。尽管仁太感到为难，但还是答应了。为了实现芽衣子的愿望，曾经疏远的伙伴们再次聚集在一起，重新面对过去的伤痛与回忆，努力弥补内心的遗憾。在这个过程中，他们逐渐找回了曾经的友情，并学会了如何面对失去与成长。