《我们的雨色协议》讲述高二学生时野谷瞬与母亲和妹妹三人生活的故事。父亲因事故去世后，妹妹受伤，瞬放弃了曾经痴迷的游戏，转而在电子竞技咖啡馆「FOX ONE」工作。他与青梅竹马的游戏朋友保持着联系，同时兼顾打工和学习。某天，瞬发现「FOX ONE」背负巨额债务，为了偿还债务，他与伙伴们决定参加「XAXXERION锦标赛」，争取奖金。怀着内疚的心情，瞬重新踏入线上游戏的世界，并遇到曾与他并肩作战的「爆裂君」。在未知的相遇和激烈的战斗中，瞬与伙伴们一同面对挑战。这是一个关于少年、家人和伙伴们的故事，通过游戏展开的全新世界。