《命运 冠位指定 绝对魔兽战线巴比伦尼亚》讲述了人理续存保障机构·迦勒底的御主藤丸立香与亚从者玛修·基列莱特为了拯救人类史，前往第七个特异点——纪元前2655年的古代美索不达米亚的故事。在这个时代，乌鲁克之地由贤王吉尔伽美什统治，然而三柱女神与众多魔兽的侵袭使这片繁荣的土地面临灭亡危机。藤丸与玛修通过灵子转移抵达乌鲁克，目睹了人类在魔兽威胁下顽强求生的景象。他们与吉尔伽美什及乌鲁克的战士们并肩作战，抵御诸神与魔兽的进攻。这里是人与神分道扬镳的时代，藤丸与玛修将在此展开最后的战斗，试图改变人类灭亡的命运。