《迷失第三季》延续了幸存者们在小岛上的神秘冒险。杰克、凯特和索亚被岛上原住民“其他人”俘虏，关押在设施完善的监狱中。与此同时，剩余的幸存者继续探索岛屿，试图寻找同伴的下落。随着剧情发展，“其他人”的真实目的逐渐浮出水面，他们与达摩计划有着密切联系。新角色朱丽叶的加入为故事带来更多谜团，她似乎既是“其他人”的一员，又对幸存者抱有同情。本季揭示了更多关于小岛超自然力量的信息，包括能预知未来的雅各布和黑烟怪物的真相。随着双方冲突升级，幸存者们必须决定是继续对抗还是寻求合作，而每个人物背后的秘密也在这一过程中被层层揭开。