《死亡代理人》的故事發生在一個人類與機器共存的未來世界，名為“Romdo”的城市是一個被嚴格管制的“不需要感情的樂園”。在這裡，每個人都配有一台名為“Autoreiv”的機器人，用於監測人類的感情波動，而人類也時刻提防著這些機器人，避免它們感染上名為“Cogito”的自我意識。這種相互制衡的關係被一系列神秘的殺人事件打破。市民情報局的調查員Rilu負責調查這些案件，她逐漸發現事件背後隱藏著更為複雜和黑暗的真相。隨著調查的深入，Rilu的人身安全受到威脅，各種怪物和機械相繼出現，試圖阻止她的行動。究竟Romdo背後隱藏著怎樣的秘密？Rilu能否揭開這一切的真相？故事將帶領觀眾一步步揭開謎團。