《犯罪现场调查第九季》继续聚焦拉斯维加斯CSI团队破获离奇罪案的故事。本季以Grissom团队调查赌场富豪连环谋杀案开场，发现所有受害者均被注射罕见蛇毒。随着调查深入，法医Warrick卷入贪污指控并遭枪击身亡，引发团队震荡。Nick在侦办酒店纵火案时被困火场，揭露了建筑商勾结消防官员的黑幕。Catherine接手一桩涉及市长候选人的性丑闻凶杀案，而Greg则通过新型DNA技术破获了沉积20年的芭蕾舞者悬案。季终集里，Grissom在破获模仿开膛手杰作的博物馆凶案后突然辞职，留下未解的蓝漆杀手谜团。本季通过12个独立案件穿插主线，展现了团队在物证与人性的博弈中面临的职业与道德抉择。