时间裂缝在东京上空无声蔓延，少女羽田千晴的制服裙摆突然被1945年的热风吹起。她攥紧手中那枚会预知灾难的怀表，身后传来队友的呼喊——这支由未来派遣的"时光巡逻队"，正用青春对抗着历史长河里最危险的涟漪。
第二季的危机潜伏在时间悖论的阴影中。当千晴发现自己的祖母竟是首个时空偷渡者，而队友龙崎凉的机械义肢开始不受控地闪现纳粹实验室的记忆，团队信任被彻底撕裂。平行世界的昭和东京里，霓虹灯与军国主义标语诡异共存，他们必须赶在时空坍缩前，修复那个被篡改的"珍珠港事件未爆发"节点。
最残酷的选择来自最温柔的队员星野葵。她握着能抹杀自己出生时间线的按钮，而倒计时显示器上，正跳动着母亲难产的精确时刻。