《如宝物般的玻璃珠》改编自同名漫画，讲述了高三那年夏天，宝偶然安慰了哭泣的大进，这一幕让大进难以忘怀。为了追寻这份情感，大进从福冈追到东京的大学，找到了宝。起初，大进并不明白自己对宝的那份心情究竟是什么，但随着时间的推移，他逐渐对宝产生了情愫。某次迎新聚餐后，大进喝醉了，被宝带回公寓照顾。趁着醉意，大进鼓起勇气向宝告白。第二天早晨，宝吻了吓得一脸苍白的大进，并说：“接吻感觉不糟，所以跟你交往。”两人开始交往后，经历了长时间的相处，宝却突然提出想回到自己的住处，这让大进感到困惑与不安。故事继续围绕着两人之间的情感变化展开，探讨了青春与爱情的微妙与复杂。