《陨落星辰第三季》故事开始于第二独立团抵达查尔斯顿七个月后。查尔斯顿被指定为“新美利坚合众国”的首都，Tom Mason被推选为政治领袖，相当于总统。然而，他大多数时间并非在办公室处理政务，而是率领军队顽强抵抗外星入侵者的进攻。与前任Manchester博士相比，Tom在对待外星人的态度上更为谨慎和务实。与此同时，外星势力的威胁日益加剧，人类内部的矛盾也逐渐浮现。Tom不仅要应对外部的敌人，还要面对内部的权力斗争和信任危机。在生死存亡的关键时刻，Tom和他的团队必须团结一致，寻找战胜外星入侵者的方法，为人类的未来争取一线生机。