在《旅行护士第二季》中，那须田步（冈田将生 饰）与九鬼静（中井贵一 饰）这对医疗搭档面临日本医疗体系的新挑战。随着"工作方式改革"推行，医生短缺与工时限制让医疗现场陷入更深的混乱。两人受雇于地区核心医院"西东京综合医院"，发现前任院长离奇死亡背后隐藏着医疗腐败。面对制药公司勾结、数据篡改等黑幕，步用天才医术拯救生命，静则以老练手段周旋各方势力。新加入的年轻护士森田望智与神秘研究员风间俊介带来更多变数，而医院内部安达祐实饰演的护士长与内藤刚志扮演的副院长各怀心思。当突发大规模感染事件爆发，旅行护士们必须在有限资源下，揭露真相并守护最后的医疗尊严。