《奇迹的苹果》讲述了一个感人至深的真实故事。木村秋则（阿部隆史 饰）是青森县中津轻郡岩木山脚下的一名果农，因妻子美荣子（菅野美穗 饰）因长期接触农药而患病，他决心放弃传统种植方式，培育无需农药的纯天然苹果。这一决定被村民们视为不可能完成的任务，但木村坚持不懈，开始了长达十几年的研究。在这过程中，他不断遭遇失败，家庭也濒临崩溃，但他始终没有放弃。妻子美荣子和岳父征治（山崎努 饰）成为他坚强的后盾。最终，木村的努力迎来了奇迹般的转机，他成功种植出了无农药苹果，创造了农业史上的奇迹。影片展现了木村秋则在逆境中的坚持与对家人的爱，感人至深。