《这不是误会》讲述了纪律检查干部姜钟琪（霍秀饰）在调查菜市场违纪事件时面临的亲情与职责的抉择。故事开始于姜钟琪接到两封举报信：一封指控水产组营业员李晓青（陈烨饰）收受华侨券，另一封则是李晓青举报水产大组长孙水康（迟重瑞饰）在批发过程中弄虚作假。作为菜市场经理姜维平（铁牛饰）的妹妹，同时又是孙水康的女友，姜钟琪陷入了两难境地。随着调查深入，她发现晓青和水康这对先进工作者之间存在着复杂关系，而市场里顾客因买不到水产引发的骚乱更让情况雪上加霜。面对亲情、爱情与工作职责的考验，姜钟琪必须秉公处理这场看似误会实则暗藏问题的违纪事件。