《通天干探国语》讲述少林武僧火新（元彪饰）原是香港神勇干探，因家庭变故和误杀青年而遁入空门。多年后他随师兄弟返港表演时，城中突发离奇命案——受害者皆莫名发热发狂自残致死，连火新的前上司也惨遭毒手。重案组督察韦晋（陈豪饰）联手心理医生黄晶莹（黎姿饰）展开调查，发现案件与神秘生化实验有关。火新被迫重出江湖，运用少林功夫与刑侦经验协助破案，过程中与晋产生理念冲突，又与前妻（邵美琪饰）重逢。随着蒙嘉慧、郑嘉颖饰演的关键人物卷入，真相逐渐指向跨国犯罪集团。众人必须在48小时内阻止致命病毒扩散，而最终的阴谋竟与火新当年的误杀事件紧密相连。