《神盾局特工第六季》讲述了科尔森去世后，神盾局团队面临新的威胁的故事。随着科尔森的离去，团队陷入迷茫，但他们很快发现一个与科尔森长相一模一样的陌生人正在宇宙中引发混乱。这位神秘人物名为萨吉，他不仅拥有与科尔森相同的容貌，还掌握着强大的力量。神盾局必须阻止他，同时解开他的真实身份之谜。与此同时，团队内部也面临着信任危机，尤其是黛西和梅之间的矛盾逐渐加深。随着萨吉的真正意图浮出水面，神盾局意识到他们必须团结一致，才能应对这场前所未有的危机。本季延续了系列一贯的动作与科幻元素，同时深入探讨了角色之间的情感与信任。