《奇门鬼谷》讲述了春秋战国时期，孙膑与庞涓这对患难兄弟的故事。两人一同拜师于鬼谷子门下，学习道术。孙膑的叔父孙乔一家为保护“孙子兵法”，被杀手组织首脑聂云的义女钟离艳杀害。临终前，孙乔命孙膑前往寻找孙兰，以获取兵法。在鬼谷子的帮助下，孙膑寻到孙兰，但杀手追至，孙兰牺牲前将女儿百里香托付给孙膑。二人随鬼谷子回鬼谷继续学道。与此同时，司马静的父亲司马平被谋杀，她投靠鬼谷子，并与孙膑、庞涓、百里香等人产生了一段多角恋情。然而，孙膑心中只钟情于钟离艳。庞涓下山投靠魏国，因魏王更倚重孙膑，加上他对司马静暗恋孙膑的不满，设计陷害孙膑。孙膑受尽屈辱，最终逃脱并施计报复，诛恶除奸。然而，钟离艳和百里香因助他而牺牲。孙膑黯然返回鬼谷，专心学道，结束了这段纷繁复杂的江湖恩怨。