《机动战士高达 雷霆宙域》的故事发生在宇宙世纪0079年，地球联邦与吉翁公国之间的一年战争末期。背景设定在被称为“雷霆宙域”的暗礁区域，这里充满了被摧毁的殖民地残骸和战舰碎片，由于带电碎片的碰撞，宙域中不断闪现着雷电。地球联邦的“摩尔同胞团”与吉翁公国的“活死人中队”在这片危险的宙域中展开了激烈的战斗。摩尔同胞团的成员们为夺回被吉翁军占领的故乡殖民地而战，而活死人中队则是一支由伤残士兵组成的特殊部队，他们驾驶着经过改造的机动战士，誓死保卫吉翁的利益。双方在战场上的交锋不仅是对技术的考验，更是对人性与信念的深刻拷问。故事通过残酷的战争场景，揭示了战争对个体的毁灭性影响以及士兵们在绝境中的挣扎与救赎。