《覆雨翻雲》講述明朝年間，失憶的風行烈（林峰飾）不知自己是蒙古國王子，性格自由不羈。為博取靳冰雲（郭羨妮飾）一笑，他決定奪取武林寶劍覆雨劍，因而與韓柏（黃宗澤飾）不打不相識，兩人成為好友。然而，覆雨劍卻被冰雲送給大魔頭龐班（郭政鴻飾）。原來冰雲深愛龐班，為此出賣風行烈，導致他武功盡失並被追殺，幸得韓柏相救。此時韓柏已得赤尊信真傳，武功大增。龐班所做一切實為輔佐風行烈復國，而復國最大阻礙正是韓柏。要發揮覆雨劍的威力，需練成“劍心通明”，唯有慈航靜齋大弟子秦夢瑤（佘詩曼飾）能與風行烈共練此劍，但秦夢瑤立場堅定，忠於大明。風行烈決定以情打動她。同時，明室內奸浮現，燕王朱棣面臨天命與冤屈，需做出重大抉擇。