《暗黑者3》延续了前两季的悬疑刑侦风格，故事围绕一系列神秘案件展开。一张张署名“暗黑者”的死亡通知单再度出现，警方专案组重新集结，由罗飞带领的团队与神秘凶手展开激烈较量。随着案件调查的深入，专案组发现这些案件背后隐藏着更大的阴谋，涉及多方势力的斗争与复杂的利益纠葛。与此同时，龙宇集团遭受新兴势力的打压，阿华拼尽全力守护邓家产业，而罗飞则周旋于各方之间，设下重重计谋。另一边，薛天在监狱中的生活也不平静，一支神秘铅笔的丢失引发了一系列血腥事件。案件的真相逐渐浮出水面，一个惊人的秘密即将被揭开，专案组与暗黑者的对决也进入了白热化阶段。