《不一样的美男子》讲述了高远树（张翰饰）在向相恋七年的女友童雨晨（吴映洁饰）求婚时，意外遭遇海上撞船事故。这场事故牵连了他们的好友何小歉（范世錡饰）、安逸飞（方逸伦饰）等人，而事故背后隐藏着X教授吴天铭与燕超尘（纪亚文饰）研发的基因药物"艾克思1号"。药物意外泄露导致高远树一行人基因突变，获得了磁场控制、读心术、预知未来等超能力。随着能力觉醒，他们发现自己被卷入了一个惊天阴谋，不得不肩负起对抗黑暗势力的使命。在探索真相的过程中，这群拥有特殊能力的年轻人不仅要面对身份转变的困惑，还要在友情、爱情与责任间做出抉择。