在近未来的日本，平凡少年星川勇气意外获得神秘能量核心「三乘合体」，成为变形金刚GO小队的指挥官。当沉睡千年的古代变形金刚「威士忌威士忌」苏醒并企图控制现代科技网络时，勇气与三名能变形为赛车的伙伴——速度型「闪电冲刺」、力量型「岩钢巨盾」、智慧型「数据星云」组成特别战斗部队。他们通过独特的「三乘合体」系统，将三种不同特性的机体合成为终极战士「星辰帝王」，在东京湾地下遗迹与富士山数据要塞等地展开激战。随着战斗升级，小队发现威士忌威士忌的真实目的竟是重启远古变形金刚的「文明重置程序」，而勇气体内流淌的星川一族血脉，竟与变形金刚的起源有着惊人联系......