由于阿笠博士家的浴室故障，江户川柯南跟随小兰和灰原哀前往大众浴池洗澡。在浴池中，柯南不慎滑倒撞伤头部，随后被两名神秘男子带走。这两人分别是天才诈欺师娜娜和职业杀手近藤，他们将失忆的柯南带到隐蔽别墅，假扮成他的父母。与此同时，追踪柯南的阿笠博士和灰原遭遇严重车祸。娜娜所属的犯罪团伙正策划一起炸弹袭击，而杂志编辑水岛早苗怀疑丈夫近藤有外遇，委托毛利小五郎展开调查。随着时间推移，隐藏在背后的阴谋逐渐浮出水面，柯南必须在恢复记忆后阻止这场恐怖袭击。本片是《名侦探柯南》连载二十周年特别企划，特邀《盗钥匙的方法》导演内田贤治担任编剧。