在火星探测任务带回的潘多拉魔盒意外开启后，日本被神秘能量墙分割为东都、西都、北都三个区域。十年后，东都街头流传着对抗"猛击者"怪人的假面骑士Build传说。失忆的天才物理学家桐生战兔正是这位骑士的真身，他手持满装瓶罐变身战斗，同时追寻自己消失的记忆。随着战兔与热血青年万丈龙我相遇，两人逐渐卷入政府阴谋、国家战争与外星生命体的漩涡中。当战兔发现自己是邪恶组织"浮士德"改造的实验体时，他必须面对"为守护人类而战"与"作为兵器被制造"的双重身份，最终与同伴们揭开潘多拉魔盒的真相，阻止毁灭世界的"天空之壁"危机。