《非自然死亡》讲述了在非自然死亡原因研究所（UDI）工作的法医三澄美琴（石原里美饰）与同事们追查死亡真相的故事。作为解剖医生，美琴坚信每个非自然死亡的背后都隐藏着必须揭露的真相，无论是谋杀、医疗事故还是未知疾病。在日本多数非自然死亡未经解剖就被火化的现状下，她与个性迥异的同事们——包括冷静理性的中堂系（井浦新饰）、新人法医六郎等——通过缜密的尸检和调查，揭开一个个死亡谜团。每集聚焦不同案件，在破解医学谜题的同时，也折射出社会现实与人情冷暖。美琴坚持"死者也有尊严"的理念，用专业与执着为无声的死者发声，直面司法体制与世俗偏见的重重阻碍。