《鳄鱼与牙签鸟》讲述了小镇姑娘李南恩热爱中国传统文化,大学毕业后前往法国波尔多大学学习建筑学。她阴差阳错地加入了“高级动物研究社”,该社正在开发一套名为“空中花园”的生态建筑系统。研究社的灵魂人物周尔文是个高冷学霸,致力于生态环保与建筑的融合。两人性格迥异,彼此视对方为冷血鳄鱼和恼人鸟,成为冤家。周尔文质疑李南恩的才能,也不认可她推崇的中国传统建筑理念。经过一段时间的相处和磨合,他们发现各自的理论可以共通融合,对“空中花园”项目有极大益处。毕业后,社员们回国创业,面对重重阻碍,他们越战越勇,结合国内环境,因地制宜,最终取得了巨大成功,将中国文化下的成果带出国门,颠覆了全球建筑行业。