《假面骑士艾克赛德 额外结局三部曲》讲述了在《假面骑士Exaid》主线剧情结束两年后的故事。曾经被视为诸恶之源的檀黎斗成功越狱，再次引发了新的危机。新的威胁“BugStar”病毒再次出现，感染者数量急剧增加。原本已经各自踏上不同人生道路的假面骑士们，为了应对这一危机，不得不重新披上战甲，使用玩家驱动腰带变身为假面骑士，与檀黎斗展开最终对决。宝生永梦作为天才玩家，再次肩负起拯救感染者的使命，与伙伴们共同面对这场前所未有的挑战。故事中既有对过去的回顾，也有对新威胁的激烈对抗，展现了骑士们的勇气与羁绊。