《X战警：第一战》讲述了年轻的X教授查尔斯与万磁王埃里克从挚友到决裂的起源故事。拥有心灵感应能力的查尔斯与掌控磁力的埃里克相遇后，联合其他变种人组成特别小队，在CIA支持下对抗企图引发核战争的纳粹余孽肖。当肖策划古巴导弹危机时，双方在加勒比海展开终极对决。虽然成功消灭肖，但埃里克逐渐认同"变种人至上"理念，与主张和平共处的查尔斯产生根本分歧。最终在海湾激战后，理念相悖的二人分道扬镳——查尔斯创立泽维尔天才少年学校培养变种人，埃里克则组建兄弟会推行激进路线，为日后变种人世界的分裂埋下伏笔。影片展现了X战警宇宙最关键的转折点，以及两位领袖从并肩作战到势不两立的悲剧历程。