《冒牌神医》讲述了现代医学院学生秦奋意外穿越到民国时期的故事。秦奋醒来时发现自己身处一间民国豪宅，身上还穿着实验课的防护服，眼前有一个小偷正在试图撬开他从2020年带来的小药箱。经过一番对峙，秦奋得知小偷名叫马开，并了解到当地正流行一种怪病，许多人患病却无药可医。秦奋凭借现代医学知识，开始冒充神医，为病人诊治。他与马开合作，利用现代药物和医疗技术，逐渐赢得了百姓的信任。然而，随着名声越来越大，秦奋也面临着身份暴露的危险，同时还要应对当地权贵的阴谋与挑战。在治病救人的过程中，秦奋逐渐领悟了医者的责任与使命，最终不仅拯救了百姓，也找到了回到现代的方法。