《神秘人》讲述1948年国共对峙时期，中共特工燕文川意外卷入情报漩涡的荒诞故事。表面懦弱的古董商燕文川实则是潜伏高手，却被组织误认为叛徒。苏联归来的女干部窦婉茹假扮保姆贴身监视，军统站长陈恭如又强行招募他加入特务组织。燕文川不得不同时周旋于军统特工和革命同志之间：既要完成秘密任务，又要应付窦婉茹的"家政革命"。当军统发现他双重身份时，燕文川与窦婉茹在连环误会中渐生情愫，最终联手设下惊天骗局，让敌特机关自相残杀。全剧充满错位喜剧色彩，既有惊险谍战，又有令人捧腹的"同居"日常，展现了大时代中小人物的智慧与浪漫。