《医神》讲述了波斯帝国时期的一段传奇故事。11世纪时，一位英国青年为学习医术隐瞒天主教徒身份，潜入伊斯巴罕一所犹太医学院求学。他师从历史上著名的犹太学者阿维森纳，这位医学泰斗著作等身，其《医典》成为后世医学经典。影片通过虚实结合的手法，展现了在中世纪蒙昧时代，一群追求真理的医者如何突破宗教与文化的藩篱，在医学道路上勇攀高峰。与此同时，影片还穿插了香港市井小民田七与妻子当归的荒诞故事——当归为报复酗酒丈夫，谎称他是神医，引发一连串令人啼笑皆非的闹剧。两条故事线交织，既呈现了东西方医学文化的碰撞，又展现了人性百态。