《黑衣人》讲述了纽约警察詹姆斯·爱德华兹在一次追捕外星人的行动中展现出非凡能力，被招募进秘密组织"星际移民局"（简称MIB）。这个组织负责监管生活在地球上的外星人，维护宇宙和平。爱德华兹化名为特工J，与资深特工K成为搭档。他们发现邪恶的"虫族"外星人企图夺取藏在猫咪项链中的"银河系"——一个能提供无限能源的微型宇宙。若能源落入虫族之手，将引发星际战争。J和K在追查过程中揭露了虫族伪装成人类农场主的阴谋，最终在纽约世界博览会场馆展开决战。J凭借机智勇敢成功保护了银河系，而K则在任务结束后选择退休并被消除了记忆。J接替K成为MIB的王牌特工，继续守护地球不被外星威胁侵扰。影片以幽默风趣的方式展现了外星移民在地球的隐秘生活，以及特工们用记忆消除器掩盖真相的日常工作。