炎炎夏日，大雄为了寻找传说中的独角仙而苦恼不已。在哆啦A梦和哆啦美的帮助下，他们使用时光圈前往500年前的新西兰，却意外捕获了早已灭绝的恐鸟。为了不让恐鸟再次灭绝，他们决定将其送往奇迹之岛——一个由未来科学家建立的、专门收留和保护灭绝动物的神秘岛屿。传说岛上栖息着黄金独角仙，这更激起了大雄的好奇心。在奇迹之岛上，他们不仅遇到了各种珍稀动物，还结识了岛上的守护者们。然而，一群偷猎者的出现打破了岛上的平静，他们企图捕捉黄金独角仙牟利。为了保护奇迹之岛和这些濒危动物，大雄和伙伴们与偷猎者展开了一场惊险刺激的冒险。最终，他们成功挫败了偷猎者的阴谋，让奇迹之岛恢复了往日的安宁。