哈利·波特结束了假期，即将回到霍格沃兹继续学习魔法。一个叫多比的家养小精灵突然出现，警告哈利不要返校，否则会陷入危险。哈利没有听从劝告，返回了学校。很快，霍格沃兹接连发生怪事：多名学生被石化，原因不明。哈利总能听到墙壁里传出奇怪的声音。传说学校有一个密室，里面藏着伏地魔年轻时的秘密，只有斯莱特林的继承人才能打开。当哈利发现自己能听懂蛇说话时，谣言四起，指认他就是开启密室的凶手。哈利与朋友们展开调查，最终发现密室中潜伏着蛇怪，而幕后黑手正是伏地魔年轻时的记忆——汤姆·里德尔。哈利在凤凰福克斯的帮助下击败蛇怪，摧毁了里德尔的日记，解救了被石化的金妮，再次挫败了伏地魔的阴谋。