《塞纳河之乱》讲述了一场发生在法国巴黎的灾难。垃圾堆街老鼠猖獗，这些老鼠体型巨大且极具攻击性，短短一周内已发生多起咬人事件。医院收治了一位在泳池被老鼠咬伤的病人，除鼠工保罗也在工作中被老鼠咬伤，导致他头晕出汗，最终住院。一只走失的小猫掉入垃圾桶后，被老鼠啃食得只剩骨头。老鼠的繁殖能力惊人，它们的老巢竟藏在医院实验室的一处废旧仓库。老鼠从这里四处出击，咬伤的人数不断增加。医生试图用激素将老鼠引至游泳池，并准备出动军队消灭它们，甚至连携带病毒抗体的小白鼠也被列入清除名单。然而，致病的老鼠并未被完全消灭，远处，新的一窝老鼠又悄然出生，危机仍未解除。