《国家宝藏2：夺宝秘笈》延续了冒险家本·盖茨的寻宝传奇。这次他卷入了一桩与美国历史悬案相关的阴谋——林肯总统遇刺事件。在一次公开演讲中，神秘男子米奇·威尔金森声称盖茨的祖父与林肯之死有关联。为洗清家族名誉，盖茨开始调查凶手约翰·布斯背后的真相，发现关键线索指向一本名为"国家密宗"的秘典。这本记载着国家机密的宝典只有美国总统知晓其下落。为查明历史真相，盖茨不得不策划一场惊险行动：绑架现任总统。在好友雷利和女友艾比盖尔的协助下，他不仅要解开层层历史谜团，更要面对来自各方势力的追击，展开一场横跨华盛顿纪念碑、白宫等国家地标的冒险之旅。