《欧布奥特曼原生之初》讲述了凯和伽古拉从同伴到对立的故事。凯和伽古拉生活在同一颗星球，曾是并肩作战的伙伴。在历经磨难登上勇士之巅后，凯被选为欧布奥特曼，肩负起保护宇宙的使命。他们的首次任务是拯救王立行星伽农，这颗星球上有一棵“生命之树”，守护着星球的生命。伽农的女王不愿战争发生，最终决定化身为战神。然而，伽古拉出于对力量与命运的质疑，砍断了生命之树，导致地球上的生命之树种子开始发芽。凯在拯救伽农的过程中，逐渐成长为真正的奥特战士，而伽古拉则走上了另一条道路，两人的命运从此分道扬镳。故事展现了凯的成长与伽古拉的复杂内心，以及他们对正义与力量的不同理解。