《无限使徒与十二战姬》讲述了一个魔法世界的故事，在这个世界中，十二位实力强大的使徒掌控着海洋、军队甚至时间的力量。其中，来自东方的“无限使徒”祐尔曼是最强的存在，但他深知强大的力量无法带来真正的幸福。为了寻找内心的充实，祐尔曼隐去身份，以普通人的身份来到人类大陆。在一次冰原战役中，他意外救下了佛兰姆帝国的火系大魔法师可儿，并抹去了她与自己相关的记忆。随后，祐尔曼误入皇家学院，在学习魔法的过程中结识了身世神秘的学院女神爱莎和武力值超群的少女艾吉尔。随着故事的展开，祐尔曼的真实身份逐渐被各方势力察觉，隐藏在人类中的邪恶势力也开始蠢蠢欲动，一场关乎世界命运的冒险就此展开。