《假面骑士 令和第一世代》讲述了由于时劫者篡改历史，世界被AI机械人Humagear统治。飞电或人从荒废的世界中苏醒，发现自己的社长身份以及假面骑士ZEROONE的力量已被Humagear的威尔及另类ZEROONE夺走。为了夺回原本的世界，或人与恢复假面骑士记忆的常磐庄吾联手，前往12年前所有事件开始的源头。然而，或人意外遇见了因12年前“破晓事件”而死亡的父亲飞电其雄，并且其雄竟然能够变身为假面骑士1型。父子二人面对过去的真相与未来的抉择，展开了一场跨越时空的激烈战斗。在这场拯救世界的旅程中，他们的命运将如何交织？未来又将走向何方？