《攻壳机动队 第一季》设定在2030年的日本，随着义体化和网络技术的普及，犯罪手段日益高科技化。公安9课作为秘密特种部队，专门处理这类棘手案件。队长草薙素子带领团队，包括狙击手巴特、黑客石川等成员，游走于法律边缘打击犯罪。本季围绕多个独立案件展开：从政治暗杀到AI失控，从记忆篡改到政府阴谋。其中"笑脸男"事件贯穿始终，这个能篡改他人视觉的黑客，不断揭露企业腐败与权力黑幕。随着调查深入，9课发现所有案件背后都指向一个庞大阴谋——政府高层试图通过"2501计划"制造可控的电子意识。最终素子在与AI程序"傀儡师"的对抗中，开始思考人类与机械意识的界限。