21世纪末，人类科技高度发达，克隆技术和宇宙航行已成为现实。科学家伊丽莎白·肖和查理·赫洛维在研究人类起源时，发现地球上的古老文明中存在着相似的神秘符号，指向宇宙深处的一颗星球。他们推测，这可能是人类起源的线索。于是，他们加入了一支探险队，乘坐宇宙飞船“普罗米修斯”前往这颗星球。抵达后，探险队发现了一座巨大的外星建筑，并在其中找到了与人类DNA相似的外星生物遗骸。然而，随着调查的深入，他们逐渐揭开了令人震惊的真相：这些外星生物可能是人类的创造者，但他们也曾试图毁灭人类。探险队面临外星生物的威胁，逐渐陷入恐怖与死亡的漩涡，伊丽莎白·肖则决心继续追寻真相，揭示人类的真正起源。