《科学小飞侠 Crowds Insight》的故事发生在2015年的东京都立川市，这是一个高科技与社交网络深度融合的世界。城市中突然出现名为“MESS”的未知存在，引发骚乱与危机。主角一行作为“Gatchaman”成员，利用特殊笔记本“NOTE”将灵魂能力实体化为铠甲，对抗“MESS”并维护和平。与此同时，社交平台“GALAX”正悄然改变城市，其用户“GALAXER”通过人工智能“X总裁”的指导互助解决问题，形成横向社会。但“GALAX”名人“LOAD”质疑“Gatchaman”的正义性，双方理念冲突逐渐升级。故事探讨了技术、社会与个体责任的复杂关系，展现了不同立场下的理想碰撞。