《捷德奥特曼剧场版 连接吧！心愿！！》讲述了朝仓陆（滨田龙臣饰）化身的捷德奥特曼面临宇宙级危机的故事。巨大的敌人吉尔巴利斯企图抹杀全宇宙的智慧生命体，甚至击败了众多奥特战士。为了阻止吉尔巴利斯的阴谋，朝仓陆与同伴们从伽古拉那里得知线索，前往冲绳寻找关键道具“赤钢”。在那里，他们遇到了库西亚人比嘉爱琉，并在她的帮助下找到了“赤钢”。然而，朝仓陆却无法唤醒“赤钢”的力量。与此同时，吉尔巴利斯的手下加拉特隆军团开始攻击地球，寻找“赤钢”。关键时刻，欧布奥特曼和赛罗奥特曼现身支援，与捷德奥特曼并肩作战。面对强大的敌人，朝仓陆的决心唤醒了捷德奥特曼的终极形态，并使用最强武器Giga终结者展开最终决战。在这场关乎地球存亡的战斗中，捷德奥特曼能否成功阻止吉尔巴利斯的毁灭计划？