在不久之前,市内发生了连环杀人事件,遇害人每一个都是音乐家,而且他们均出身于著名钢琴家领衔创建的一所音乐学院。江户川柯南、毛利小五郎、毛利兰、少年侦探团等一行人,收到了一位著名钢琴家的邀请,出席由他出资建造的音乐厅的落成典礼音乐会。该音乐会最大的亮点是巴赫弹奏过的管风琴、世界著名的斯特拉迪瓦里琴的音色。然而,随着音乐会的临近,柯南发现这些案件与音乐厅有着千丝万缕的联系。在调查过程中,柯南利用绝对音感破解了隐藏在乐谱中的密码,逐渐揭开了凶手的真实身份和动机。最终,在音乐厅的舞台上,柯南与凶手展开了一场惊心动魄的对决,成功阻止了悲剧的再次发生。