《机动战士高达 Ⅱ 哀・战士篇》讲述了在人工卫星上生活的新人类“COORDINATOR”与地球联合之间的冲突。C.E.70年2月11日，地球联合与Z.A.F.T.因经济摩擦陷入对立，外交手段无法解决争端，最终双方宣布开战。战争的导火索是“血染情人节”事件，地球联合利用核弹攻击了新人类的卫星，造成大量伤亡。这场战争不仅将中立势力拖入战斗，也让许多无辜少年卷入其中。基拉·大和是一名工业大学学生，曾与新人类领袖萨拉议长的儿子阿斯兰是好友。阿斯兰回国后，基拉过着平静的生活，直到某天ZAFT军来到学校抢夺高达，基拉意外进入高达内部，开始了与阿斯兰的对战。故事展现了战争带来的痛苦与少年们在战火中的挣扎与成长。