《剧场版 再见了假面骑士电王 最后的倒计时》讲述了假面骑士电王与异魔神们的最终战役。桃塔罗斯一行人结束了与异魔神的战斗，过上了平静的生活。然而，街头突然出现了一辆神秘的幽灵列车，打破了他们的安宁。叶奈与桃塔罗斯等四位异魔神决定调查此事，却在途中遭遇了被绑架的良太郎。他们发现幽灵列车的背后隐藏着更大的阴谋，敌人试图通过操控时间线来改变历史。为了阻止这一切，桃塔罗斯与伙伴们再次集结，展开了激烈的战斗。在最终的对决中，他们不仅要面对强大的敌人，还要面对时间的残酷考验。假面骑士电王的命运将何去何从？这场战斗将成为他们最后的倒计时。