蔚蓝的海洋深处，巴克队长正带领小纵队执行例行巡逻。突然，声呐系统捕捉到异常信号——一群惊慌的鲸鱼正被虎鲨群围猎。与此同时，年幼的座头鲸小灰与母亲失散，独自在暗流中挣扎。
章鱼堡的警报响彻走廊，皮医生迅速准备医疗包，达西西调出三维海流图。这场看似普通的捕食行为背后，隐藏着更危险的真相：海底火山异常活动迫使鲨鱼改变了迁徙路线。谢灵通发现鲸群歌声中夹杂着求救频率，而呱唧则注意到虎鲨首领背鳍上的旧伤疤……
当小纵队成员分头行动时，巴克队长必须做出抉择：是遵循"不干预自然法则"的守则，还是为拯救两个濒临冲突的族群冒险？暗流中，小灰用颤抖的声波唱起了母亲教它的歌谣。