《止杀令》讲述了长春真人丘处机为拯救天下苍生，毅然踏上西域之旅的故事。丘处机隐居昆嵛山，传闻他已活300岁，通晓生死之道。成吉思汗得知后，命刘仲禄远赴中原请他出山。丘处机预知此行凶多吉少，但为了天下百姓免受战乱之苦，他带着一口棺材，毅然启程。徒弟赵道安不忍师父独自受苦，誓死跟随。途中，契丹女三次变换身份，企图借丘处机之手复仇。经过多次心战，丘处机以天道喜善恶杀之理点化成吉思汗，使其明白珍惜生命的意义。成吉思汗顿悟后停止征伐，班师东归，并封丘处机为大国师。丘处机的西行不仅化解了战乱，还为蒙古将士传授卫生之道，遏制了瘟疫的蔓延。