《名侦探柯南：计时引爆摩天楼》讲述柯南收到建筑大师森谷帝二的晚会邀请，与毛利兰和毛利小五郎一同出席。晚会上，森谷教授展示了自己设计的城市建筑模型，却对其中部分作品表示不满。随后东京接连发生爆炸事件，目标全是森谷年轻时设计的建筑。警方发现所有爆炸都使用特殊塑胶炸弹，而犯人竟直接致电挑衅柯南。当犯人得知工藤新一未出席晚会后，愤怒地将最终目标锁定为新一与兰所在的米花市政大楼。在炸弹倒计时的最后时刻，柯南必须解开犯人设下的谜题，才能拯救被困在摩天楼里的兰和无数市民。随着真相揭晓，森谷教授偏执的完美主义与扭曲的报复心理令人唏嘘，而柯南与兰隔门拆弹的生死抉择更将紧张感推向高潮。