一天，宇宙开发中心的上空突然出现了一艘来历不明的宇宙飞船，一名神秘女子也随之现身。随后，城市遭到了两只怪兽的袭击。高斯奥特曼迅速赶到现场与怪兽展开战斗，但怪兽极为顽强，高斯几乎无法抵挡。危急时刻，春野武藏挺身而出，与高斯融为一体，使得高斯的力量大幅增强。就在怪兽即将被击败之际，杰斯提斯奥特曼突然出现，她不仅阻止高斯保护地球，还导致高斯和武藏被怪兽击败。原来，神秘女子来到地球是为了维持宇宙秩序，计划消灭地球上所有生物。地球各国纷纷采取行动，试图自救，但高斯的死亡似乎预示了地球的末日。就在绝望之际，武藏的亲人和队友坚信高斯和武藏并未死去，他们四处奔走，期盼奇迹的出现。